Μπορείτε να προσαρμόσετε το DeskPins κάνοντας δεξί κλικ στο εικονίδιό του στο tray και διαλέγοντας "Επιλογές..." από το μενού. Το πλαίσιο διαλόγου Επιλογές θα εμφανιστεί. Οι ρυθμίσεις του προγράμματος είναι κατηγοριοποιημένες σε ορισμένες σελίδες:
Πατήστε το κουμπί Βοήθεια οποιαδήποτε στιγμή για να πάρετε πληροφορίες για την τρέχουσα σελίδα. Όταν τελειώσετε τις αλλαγές, πατήστε OK για να τις σώσετε και να τις εφαρμόσετε ή το Άκυρο για να τις ακυρώσετε. Πατώντας το κουμπί Εφαρμογή μπορείτε να σώσετε τις αλλαγές και να διατηρήσετε το παράθυρο διαλόγου ανοιχτό· αυτό είναι χρήσιμο όταν θέλετε να πειραματιστείτε με διάφορες ρυθμίσεις (π.χ. το χρώμα της καρφίτσας).